Předmětem sporu bylo to, zda měl správce daně právo zahájit daňovou kontrolu místo postupu k odstranění pochybností. V rámci řízení byla řešena mimo jiné otázka, zda správce daně má povinnost při zahájení daňové kontroly sdělovat důvody pro její zahájení, tedy konkrétní pochybnosti, jako je tomu v případě postupu k odstranění pochybností. Stěžovatel se domníval, že nesdělení těchto důvodů způsobí nezákonnost postupu správce daně.
NSS konstatuje, že pro účinné zahájení daňové kontroly není podmínkou, aby správce daně sdělil daňovému subjektu zcela konkrétní pochybnosti odůvodňující její zahájení, resp. aby mu sdělil konkrétní důvody, neboť tento požadavek stěžovatele nemá zákonný podklad a možnost zahájit kontrolu má správce daně i v případě, kdy by mohl zvolit postup k odstranění pochybností (pokud jsou zde důvody pro volbu daňové kontroly).
